LJI科学家确定了针对新型冠状病毒的免疫反应的潜在靶标
加利福尼亚州拉霍拉市-在两个月内,以前未知的冠状病毒SARS-CoV-2在全球范围内传播,感染了100,000多人,而且人数还在迅速增加。有效的对策需要有用的工具来监控病毒的传播并了解免疫系统对病毒的反应。
拉荷亚免疫研究所的一组研究人员与J.克雷格·文特研究所的研究人员合作,于2020年3月16日出版了《细胞,宿主和微生物》在线杂志,首次对有效免疫的潜在靶标进行了分析。对新型冠状病毒的反应。研究人员利用已知冠状病毒的现有数据来预测SARS-CoV-2的哪些部分能够激活人类免疫系统。
当免疫系统遇到细菌或病毒时,它会以微小的分子特征(称为表位)归零,这些特征使免疫系统的细胞能够区分密切相关的外来入侵者并集中攻击。拥有完整的病毒表位及其免疫原性图,对于试图设计新的或改良的疫苗来预防COVID-19(由SARS-CoV-2引起的疾病)的研究人员而言至关重要。
该研究的主要作者亚历山德罗·塞特(Alessandro Sette),LJI传染病和疫苗研究中心教授Biol.Sci表示:“目前,我们尚不清楚有关哪些病毒引起人类强烈反应的信息。”“了解某些病毒区域的免疫原性,换句话说,了解免疫系统对病毒的哪些部分做出反应以及强度如何,与有希望的候选疫苗的设计及其评估具有直接的联系。”
尽管科学家目前对人类免疫系统如何对SARS-CoV-2产生的反应了解甚少,但已经研究了对其他冠状病毒的免疫反应,并且可以获得大量的表位数据。
目前,其他四种冠状病毒正在人类中传播。它们通常会引起轻微的症状,并共同导致所有季节性感冒的四分之一。但是每隔几年就会出现一种新的冠状病毒,这种病毒会引起严重的疾病,例如2003年的SARS-CoV和2008年的MERS-CoV,现在是SARS-CoV-2。
Sette实验室的博士后研究员阿尔巴·格里菲尼(Alba Grifoni)博士解释说:“ SARS-CoV-2与SARS-CoV的关系最密切,就表位而言,SARS-CoV也是特征最强的冠状病毒。”
在他们的研究中,作者使用了基于LJI的免疫表位数据库(IEDB)的可用数据,该数据库包含来自3600种不同物种的600,000多个已知表位,以及Virus Pathogen Resource(ViPR),这是有关病原病毒信息的补充存储库。该小组从SARS-CoV汇编了已知的抗原决定簇,并将相应区域定位到SARS-CoV-2。
“我们能够将10个B细胞表位定位到新的冠状病毒上,并且由于SARS-CoV和SARS-CoV-2之间总体上高度相似,因此SARS-CoV中具有免疫优势的相同区域的可能性很高在SARS-CoV-2中也占主导地位。” Grifoni说。
在刺突糖蛋白中发现了其中的五个区域,这些糖蛋白在冠状病毒名称的病毒表面形成了“冠状”。膜蛋白中的两个位于包裹在病毒基因组周围的保护性蛋白外壳的膜中,而蛋白三个则形成在外壳中。
在类似的分析中,T细胞表位也主要与棘突糖蛋白和核蛋白相关。