机会性触发当抗生素或其他因素破坏肠道中正常的微生物混合时，一种叫做艰难梭菌(Clostridioides difficile)的细菌会导致严重的腹泻。

导致严重且有时危及生命的腹泻的肠道病原体是一种机会主义者，它在正确的条件下像大爆炸一样成长。现在，科学家们可能已经发现了Clostridioides difficile等待的机会。

在小鼠中，肠道中微生物混合物的破坏为艰难梭菌感染奠定了基础。研究人员10月24日在“科学转化医学”杂志上报告说，这种不适使得病原体能够通过提供更多的氨基酸脯氨酸而部分繁殖。

美国疾病控制中心和预防在2015年估计在1000以上148人发展艰难梭菌(以前称为难辨梭状芽孢杆菌)感染。这种感染通常发生在人们服用抗生素后，这可能会导致通常混合肠道微生物。

明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所的胃肠病学家Purna Kashyap及其同事进行了实验，将患有正常或干扰肠道微生物的人的粪便移植到小鼠体内。从患有正常肠道微生物组的人那里获得移植的小鼠能够比从混合受干扰的人中移植的小鼠更好地抵抗或控制艰难梭菌感染。

研究人员发现，改变的微生物混合物导致肠道中某些氨基酸的增加，尤其是脯氨酸。艰难梭菌可以使用脯氨酸作为其主要食物来源，使其比不易消耗氨基酸的微生物具有竞争优势。研究小组发现，喂食脯氨酸缺乏的小鼠食物的小鼠在其肠道中的艰难梭菌细菌比正常饮食的老鼠少得多。

Kashyap说，粪便移植在控制小鼠的艰难梭菌水平方面更有效。他说，这表明含有其他脯氨酸的细菌的益生菌可能胜过艰难梭菌，有助于恢复肠道微生物的平衡。