由加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院和摩尔斯癌症中心的18位研究人员组成的团队开发了一种新工具，可以分析经常被忽视的癌症遗传学方面，这种改变会导致基因拷贝的丢失或增加。这种变化称为体细胞拷贝数改变，可能是疾病进展的关键，并且可能为卵巢癌和其他恶性肿瘤提供新的治疗方法。

加州大学圣地亚哥分校摩尔斯分校临床翻译计划研究员乔·R·德莱尼博士说：“当大多数人想到癌症遗传学时，他们就会想到促进肿瘤形成的单个关键突变，例如BRCA基因等非常特殊的东西。”该论文的中心和主要作者于2月15日发表在《自然通讯》上。这些变化通常被称为肿瘤驱动因素，但这些并不是影响癌症生长的唯一偏差。我们探索了其他可能性。”

癌细胞中90%以上的遗传变化都涉及基因的单个拷贝的丢失或获得，而不是突变。肿瘤细胞可能只有一个副本或三个副本，而不是正常的两个副本-每个父母提供一个副本。该领域尚未深入探讨，因为其他疾病的经验告诉科学家，一个基因拷贝的丢失可能不会导致疾病症状，因为另一个父母提供的第二个拷贝会被填充。

Delaney和他的团队想知道是否真相是否丢失了几个具有相同细胞功能的单基因拷贝，以及在不同癌症中的特征可能是什么。该团队设计了Haploinsufficient / Triplosensitive Gene(HAPTRIG)计算工具，以识别被基因丢失和获得显着破坏的途径。

特别是卵巢癌充满了这些改变-超过60%的基因受到影响。当研究小组使用HAPTRIG分析这种恶性肿瘤时，突出的途径是自噬-细胞死亡的自然过程，有助于维持正常的细胞健康。卵巢癌细胞一直在使用自噬，但也会丢失数个自噬基因拷贝，从而导致容量受损。

然后，研究人员使用了美国食品药品监督管理局批准的现有药物的组合来靶向自噬，并发现卵巢癌细胞在几种不同的小鼠癌症模型中对这些药物高度敏感，甚至在对标准化学疗法具有抗性的细胞中也是如此。该研究的资深作者，摩尔斯癌症中心妇科肿瘤学副教授Dwayne G. Stupack博士说，这两种药物的组合毒性比标准化学疗法低，并且相对便宜，应进行临床评估。

这组作者说，通过进一步的工作，这一发现可能会导致治疗化学疗法耐药性疾病的新方法，并且也可能会增强对其他癌症的治疗。