CDI科学家发现了癌症与疾病风险的DNA标志
2020年6月29日-新泽西州纳特利-Hackensack Meridian Health研究人员和医生通过对整个基因组进行测序以对DNA进行修饰,并分析了癌组织和健康组织,发现了可能导致癌症和其他疾病风险的关键因素:根据新出版物,这些表达变化(甲基化)的DNA不平衡。
来自发现与创新中心(CDI),哈肯萨克大学医学中心及其约翰·瑟勒癌症中心(JTCC)和美国国家癌症研究所认可的乔治敦·伦巴第综合癌症中心联盟的作者在主要杂志《基因组》上发表了他们的发现。6月29日的生物学。
与疾病最密切相关的遗传变异可能很难在广泛的基因组扫描中定位-但是,通过放大与多个正常组织和癌组织中这些DNA甲基化失衡相关的关键遗传位置,科学家报告说,他们发现了有希望的新线索在更广泛的统计信号之下。
“我们密集的等位基因特异性甲基化分布图(即,由遗传变异决定的DNA甲基化失衡)将帮助其他科学家确定优先次序,并将他们的工作重点放在与疾病相关的最相关的遗传变异上,”医学博士Catherine Do说。 ,CDI的助理成员和第一作者。“由于我们还深入研究了这种现象的机制,以了解其如何导致疾病的易感性,因此我们的研究将有助于确定个性化医学和药物开发的新的有趣生物学途径。”
负责这项研究的CDI实验室主任Benjamin Tycko博士说:“癌细胞是黑帮,但在我们的研究方法中,我们使它们以有用的方式起作用。”“这些等位基因特异性甲基化的“足迹”在癌症中比在正常组织中更为丰富,但是由于凯瑟琳的工作表明它们是通过相同的生物途径产生的,因此我们可以使用密集的图谱来了解癌症和非癌症的起源-癌症疾病-例如自身免疫性疾病,神经精神疾病和心脏代谢异常。”
当前的研究生成了这种方法中使用的最大的高质量数据集之一。在研究的DNA样本中,有89个健康对照的各种组织类型,还有JTCC的由肿瘤科医生和外科医生治疗的三种肿瘤的16种癌症样本:B细胞淋巴瘤,多发性骨髓瘤和多形性胶质母细胞瘤(常见且难于诊断) -治疗脑瘤)。
科学家从全基因组关联研究(GWAS)中识别出总共15112个等位基因特异性甲基化位点,其中1838个位点位于疾病易感性统计信号附近。这些数据已公开提供,以便其他科学家可以在“ GWAS后”研究中检验新的假设。
在其新发现中,该论文还报道了证据,即非编码突变(不会改变蛋白质序列)“可能通过对基因表达的长期调节作用而在癌症中发挥作用”。论文中引用的一个具体例子是一种突变,该突变导致TEAD1基因中的等位基因特异性甲基化,这一证据表明在侵袭性和治疗难治性多发性骨髓瘤中过表达。