用于植物生长实验经济实惠且适应性强的远程监控
生长室是基于实验室的植物科学的基石,可以为许多实验设计提供严格控制的条件。但是,这些条件有时可能比控制的要少一些,从而造成令人头疼的问题,从重现性问题到整个实验的失败。远程监视条件会有所帮助,但设备可能很昂贵,或者缺少对特定实验很重要的功能或传感器。在最近一期《植物科学中的应用》中提出的研究中,密苏里州大学和亚利桑那大学的Makenzie Mabry女士及其同事开发了一种灵活而廉价的植物生长设施监控系统,称为Growth Monitor pi或GMpi。该系统使用开源软件和单板Raspberry Pi计算机,并且可以连接到各种不同的传感器,以满足研究人员的特定需求。
需求通常是发明之母,GMpi就是这种情况。“我们希望能够监控一些敏感的实验,但在当时走了很多,但没有找到任何东西,以低廉的价格完全达到我们的通知和警报的需求,”马布里,稿件的通讯作者说。“我们希望GMPI平易近人谁希望更密切地监测他们的工厂等植物科学家,在提醒用户在植物生长条件设施额外的安全性,或者只是想提高整个研究的重现性。”
GMpi系统的“物联网”方法最大程度地提高了灵活性,同时保持了较低的成本,这使其成为各种植物研究人员的理想工具。“我们希望研究人员可以采用适合自己研究的GMpi并对其进行扩展,”马布里说。“例如,我们认为那些对植物的表型感兴趣的人可以相对容易地为此目的改编GMpi,并保留将其用于监测植物的方法。”
GMpi系统的低成本(约200美元),可以通过开源软件和廉价的硬件来实现,也有可能吸引研究人员寻找确保其生长室实验顺利进行的方法。“许多研究人员没有足够的资金或资源来负担昂贵的监测系统,但是他们仍然想知道他们工厂的日常状况,”马布里说。“我们还认为,在整个科学领域中始终存在提高可重复性的空间,并希望通过提供一种廉价的开源平台,所有希望使用它的科学家都可以更容易地使用它。”
为了使GMpi系统更易于访问,本文提供了详细的协议,描述了必需的设备,Raspberry Pi的设置和软件安装。
除了确保可重复性外,GMpi系统还使马布里(Nabry)在攻读博士学位的密苏里大学的Pires实验室安心。“当我出门在外时,我仍然会了解箱室和设备的运行状况,当我们收到警报,表明设备超出了我们指定的温度范围时,可以委托任务来检查设备,湿度或光照,”马布里说。
看来GMpi系统有许多用途,其中许多用途是作为保护植物研究人员避免在假期周末破坏生长室的噩梦。