基因网络揭示了从健康到失败的心脏转变
调查心力衰竭的科学家仅限于在实验室研究患病的心脏组织 - 可以理解的是,因为人们不倾向于为了研究而拔出健康的心脏。但是现在,能够获得无法使用但仍然健康的供体心脏的科学家已经能够研究从健康心脏到心力衰竭过渡背后的基因组支柱。
在这样做的过程中,斯坦福大学医学院的研究人员和他们的合作者创建了第一张地图,揭示了心脏停止时的基因活动和连接。
Euan Ashley,MB ChB,DPhil,斯坦福大学遗传学和生物医学数据科学医学教授,称其为基因网络。他说,这些网络类似于社交网络。“我们可以说,我们追踪了斯坦福大学人力资源部门的下落。我们可以看到他们往往停在同一地区,去同一个办公室,并在同一个地方吃午饭,”他说。“他们一起移动,因此可以合理地推断他们彼此之间有某种联系。”
追踪心脏衰竭的基因网络是这样的,只是不是观察身体动作,阿什利和他的合作者观察基因表达的变化,注意它随着健康的心脏退化而变化。
通过描绘这些基因网络,该小组发现了一个特别是似乎处于行动中心的基因。它似乎与心力衰竭高度相关,这意味着它的活动与许多邻居的活动相似。阿什利说,更令人兴奋的是,当研究人员在心力衰竭的小鼠模型中禁用该基因的功能时,小鼠受到保护并且不会死于心脏病。
“这项研究具有一个真正独特的角度,即我们拥有珍贵,健康的人体组织,我们用它来告诉我们关于疾病如何表现的新内容,”心血管医学临床指导医师Victoria Parikh博士说。“现在有一天我们甚至可能将其转化为治疗方法。”
提供该研究细节的论文将于6月24日在Nature Communications上发表。阿什利是资深作家。Parikh是前斯坦福大学研究生Pablo Cordero博士的主要作者。跟踪过渡
阿什利说,心力衰竭不是一个简单的条件。它更像是一个总括性术语,描述了无论原因如何,心脏都无法抽血。“这可能是心脏病发作,遗传原因,高血压,瓣膜问题或完全不同的东西,”他说。“无论心脏如何恶化,我们相信最终导致心力衰竭的最终,共同途径。”
现在,他们绘制的基因网络正在提供对该途径如何展开以及哪些基因对其激活至关重要的新见解。
“也许总有一天我们能够进入一个小区并观察网络是否正在实时变化,”他说。“但是现在我们所拥有的是人体组织,这种组织在某个时刻会被冻结,因此我们可以用它来研究这个过程中涉及哪些基因。”
该组从超过300颗心脏中取出组织样本(一半来自心力衰竭患者的心脏移植心脏移植,一半来自健康供体心脏)并进行基因组测试以确定基因表达活性。阿什利说,至关重要的是要有健康的捐赠者心。“有时,出于后勤原因,捐赠者的心脏不能用于移植,因此我们不再浪费这些器官,而是将它们重新用于我们的研究。”多亏了一个全天候工作的专业多机构外科团队 - 有时候在凌晨时分冒险 - 该团队获得了100多个健康的心脏。