研究追溯了全球最受欢迎的咖啡品种阿拉比卡咖啡在过去一千年间地球变暖和变冷循环过程中的演变历程。

培育更能适应未来气候变化的咖啡树的秘诀或许可以在其古老的历史中找到。

部分由布法罗大学牵头的研究人员开发出了他们所称的阿拉比卡咖啡(世界上最受欢迎的咖啡品种)的最高品质参考基因组。这个新基因组揭示了咖啡在各大洲传承的千年秘密。

他们的研究结果最近发表在《自然遗传学》上，表明阿拉比卡咖啡是 60 多万年前在埃塞俄比亚森林中通过两种其他咖啡品种的自然交配而发展起来的。研究发现，在数千年的时间里，阿拉比卡咖啡的数量随着地球的变暖和变冷而时涨时落，最终在埃塞俄比亚和也门开始种植，然后传播到世界各地。

“我们利用当今活着的植物的基因组信息回溯历史，尽可能准确地描绘出阿拉比卡咖啡的悠久历史，并确定现代栽培品种之间的关系，”这项研究的共同通讯作者、布法罗大学文理学院生物科学系帝国创新教授维克多·阿尔伯特博士说。

星巴克和Tim Hortons等咖啡巨头仅使用阿拉比卡咖啡树的咖啡豆来冲泡他们每天供应的数百万杯咖啡，然而，由于近亲繁殖历史和种群规模小导致遗传多样性较低，阿拉比卡咖啡易受多种害虫和疾病的侵害，只能在世界上少数病原体威胁较低、气候条件更有利的地方种植。

阿尔伯特说：“详细了解当代品种的起源和育种历史对于培育更适应气候变化的阿拉比卡咖啡新品种至关重要。”

该团队利用尖端的DNA测序技术和先进的数据科学，通过新的参考基因组，对 39 个阿拉比卡咖啡品种进行了测序，甚至还对瑞典博物学家卡尔·林奈用来命名该物种的 18 世纪标本进行了测序。

参考基因组现已在公开的数字数据库中提供。

“虽然阿拉比卡咖啡确实有其他公开的参考资料，但我们团队的工作质量极高，”这项研究的联合负责人之一、雀巢研究中心基因组学高级专家帕特里克·德孔贝斯 (Patrick Descombes) 表示。“我们使用最先进的基因组学方法(包括长读和短读高通量 DNA 测序)来创建迄今为止最先进、最完整、最连续的阿拉比卡咖啡参考基因组。”