马克斯普朗克图宾根生物研究所的研究人员开发了突破性的工具 SynTracker。SynTracker 通过考虑基因组结构变异来扩展传统的微生物分析，以补充现有的基于 SNP 的方法。

这项创新揭示了微生物菌株多样性和进化的更精确和深度。SynTracker发表在《自然生物技术》杂志上，为科学家提供了物种特异性分析能力，使他们能够专注于微生物种群的基因组共线性。

SynTracker 旨在通过评估其同源性或保留短基因组序列的顺序来比较来自相关微生物菌株的基因组或基因组片段。这一令人兴奋的工具有望彻底改变微生物进化的研究。通过为研究人员提供一个强大的平台来分析和跟踪重组等结构变异事件，SynTracker 为探索微生物群落的复杂动态打开了大门。

“获得新的数据视角令人兴奋，”图宾根马克斯普朗克生物研究所微生物组科学系主任 Ruth Ley 教授说。“特别是因为我们以前从未能够以这种分辨率观察同一个体内菌株水平的演变。”

SynTracker 的优势：超越单核苷酸多态性

以前可用的工具依赖于突变。正如 Ley 教授解释的那样，如果你想研究结构变化，“我们几乎看不到微生物进化的其他方式。”

最广泛使用的菌株比较方法侧重于单核苷酸多态性 (SNP)。SNP 仅识别基因组内特定位置的单个 DNA 碱基之间的潜在差异。它们大多忽略了可能显著影响表型特征和进化途径的结构差异。