科学家们研究免疫疾病背后的DNA差异
科学家距离发现诸如哮喘,多发性硬化症和关节炎等免疫疾病的病因更近了一步。惠康桑格研究所,葛兰素史克和Biogen在“开放目标”倡议下的研究表明,与免疫疾病相关的个体之间成千上万的DNA差异与特定类型免疫细胞的开启有关。
该研究今天(9月23日)发表在《自然遗传学》上,它将有助于缩小对涉及免疫疾病的分子途径的搜索范围,并可能导致寻找开发新疗法的药物靶标。
免疫系统通过抵抗感染使我们保持健康。但是,如果出现问题,免疫系统中的细胞会错误地引起炎症,从而导致免疫疾病,例如哮喘,多发性硬化症和炎症性肠病(IBD)。这些疾病影响着全球数百万人,仅在英国就有超过500万哮喘患者*,但尚不清楚是什么触发免疫系统以这种方式甚至涉及的确切细胞类型应答。
先前的研究发现,成千上万的遗传变化-被称为遗传变异-在免疫疾病患者中比在健康人群中更常见。了解这些遗传变化可以为免疫疾病的病因和生物学途径提供线索,并及时发现新的药物靶标。
这些遗传变异中的许多都处于基因组了解不足的区域,并被认为参与调节免疫细胞的功能。除此之外,细胞因子-发信号的蛋白质可以在炎症过程中使免疫细胞之间进行交流-并且图像变得更加复杂,使得查明导致疾病的原因极为困难。
桑格研究所和他们的合作者的研究人员旨在了解哪种免疫细胞状态对免疫疾病最重要,从而努力寻找哮喘和IBD等疾病的潜在新药物靶标。
在这项新研究中,研究小组研究了来自健康志愿者的三种类型免疫细胞中基因组的哪些部分具有活性,并针对涉及不同免疫疾病的所有遗传变异对这些位置进行了交叉检查。他们还添加了不同的细胞因子,创建了总共55种不同的细胞状态,以模仿免疫疾病的炎症并了解信号化学物质在这些细胞中的作用。
研究发现,一种特定的细胞类型和细胞状态-记忆T细胞的早期活化-与免疫疾病中涉及的遗传变异在同一区域具有最活跃的DNA。这表明这些T细胞的初始活化在疾病发展中很重要。令人惊讶的是,研究表明,细胞因子通常仅对DNA活性具有微妙的影响,而在大多数所研究的疾病中所起的作用较小。
惠康桑格研究所和开放目标组织的论文的主要作者布拉戈耶·索斯基奇博士说:“我们的研究是在与免疫疾病相关的遗传差异的背景下对免疫细胞和细胞因子信号进行深度分析的第一项研究。我们发现了联系在疾病变异和记忆T细胞的早期活化之间进行研究,表明调节这种早期T细胞活化的问题可能导致免疫疾病。”
GSK公开目标管理委员会主席兼适应性免疫和免疫表观遗传学研究组负责人Rab Prinjha博士说:“在GSK,我们同时部署了遗传学和基因组学,以识别免疫系统的哪些部分对一系列免疫系统至关重要。人类疾病,并产生更好的经过验证的可能成为转化医学的靶标为了研究免疫系统的科学,功能基因组学可以帮助我们更好地理解单个基因在触发病原性免疫机制中的作用。我们与Open Targets进行了5年的合作,以推动该领域的发展,并显示了我们对推动科学发展的先进技术的关注。”
为了进行这种复杂的分析,研究人员开发了一种新的计算方法,称为CHEERS,使他们能够识别与免疫疾病相关的细胞状态。该资源公开可用**,也可用于寻找遗传变异与其他复杂疾病机制之间的联系。
威康大学桑格研究所和开放目标组织的资深作者戈西亚·特伦卡博士说:“体内有成千上万种不同的细胞类型和状态,发现自身免疫性疾病的原因就像在大海捞针中找到针头。确定记忆T细胞的早期活化与免疫疾病特别相关,现在将能够更深入地研究它的调控方式,发现可用作药物靶标的基因和途径。”