歌德大学的研究人员开发了新的蛋白质组学程序
由艾美奖Noether小组负责人的生物化学家ChristianMünch博士领导的团队采用了一个简单但极为有效的技巧:在质谱仪中测量所有蛋白质时,添加了增强通道以专门增强新合成蛋白质的信号,从而实现他们的测量。因此,现在可以通过最先进的定量质谱技术跟踪蛋白质合成的剧烈变化。
之所以出现这个想法,是因为该团队想了解比应力信号如何影响蛋白质合成。“由于在短时间间隔内新产生的蛋白质数量很少,因此面临的挑战是要记录每种蛋白质的很小百分比的微小变化,”该小组负责人Münch评论说。现在,新开发的分析方法为他的团队提供了对确保应激细胞存活的分子事件的详细了解。细胞对应激的反应在许多人类疾病的发病机理中起着重要作用,包括癌症和神经退行性疾病。对基本分子过程的了解为开发新的治疗策略打开了大门。
“我们开发的方法可以实现高精度的时间分辨测量。现在,我们可以分析急性细胞应激反应,即几分钟之内发生的反应。此外,我们的方法所需的材料很少,并且具有很高的成本效益,”Münch解释说。“这有助于我们在特定的应激处理后的指定时间内,同时定量数千种蛋白质。”由于所需的材料量少,因此还可以在患者组织样本中进行测量,从而促进与临床医生的合作。在葡萄牙的Proteostatis(EMBO)会议上,博士生Kevin Klann最近因其展示了使用新方法产生的第一批数据而获得了FEBS杂志海报奖。这位年轻的分子生物学家首次证明了由最完全不同的应激刺激触发的两个最重要的细胞信号通路最终对蛋白质合成产生相同的作用。这一发现是该领域的突破。
该项目由欧洲研究委员会(ERC)资助,是“ MitoUPR”启动资金的一部分,该资金已授予Münch,以研究线粒体蛋白的质量控制机制。此外,克里斯蒂安·慕尼黑(ChristianMünch)已获得德国研究基金会(DFG,Deutsche Forschungsmeinschaft)艾美奖Noether计划的资助,并且是歌德Johanna Quandt青年学院的成员。自2016年12月以来,他在哈佛大学领先的蛋白质组学实验室之一任职后,在歌德大学医学院的生物化学研究所II建立了“蛋白质质量控制”小组。